R
データの読み込み・保存
ディレクトリ
ディレクトリを操作する
データの読み込み
外部ファイルからデータをインポートする
ファイルのダウンロード
ネットワークからデータをインポートする
データの書き出し
ファイルにデータを書き出す
標準入力
データを入力する
制御構文
基本
オブジェクトクラス
Rではオブジェクトはクラス属性を持つ。
RStudio
Rのための統合開発環境
サンプル抽出
データを取り出す
例外処理
警告やエラーが出た時に対応する
文字列操作
文字列の操作方法
散布図
2変数を縦軸と横軸に点でプロットする
radian
モダンなRコンソール
環境変数
OSに保管された変数を操作する
自作関数
自分で定義した関数を作る
オブジェクトの比較
オブジェクトが同じかどうか調べる
ベクトルの集合演算
ベクトルの和集合・積集合・差集合・相当な集合
正規分布
統計学で最も用いられる確率分布
線形回帰
説明変数Xに基づいて目的変数Yをモデル化する
dnorm()の使い方
正規分布の確率密度を算出する関数
データ構造
データ構造
データ構造について
ベクトル
順序付きの同一データ型の集まり
リスト
異種データの集まり
データフレーム
Rで最もよく使われるデータの格納の仕方
データフレームの結合
データフレームにデータを追加する
時系列
時間と共に変化するデータ
パッケージ
パッケージ
Rの機能を拡張する
パッケージをインストールする
CRAN, Bioconductor, GitHubからパッケージをインストールする方法を紹介します。
msa
多重配列アライメントを行うためのパッケージ
seqinr
DNAやアミノ酸配列を解析するためのパッケージ
stringr
文字列を操作するためのパッケージ
tidyr
データをtidyに整形する
swirl
インタラクティブにRを学ぶ。
dplyr
データフレームを操作するためのパッケージ
jsonlite
JSONを処理するためのパッケージ
xml2
XMLを扱うためのパッケージ
rjson
JSONデータを処理するためのパッケージ
beeswarm
蜂群図を描くためのパッケージ。
magrittr
パイプ演算子を使うためのパッケージ
rvest
HTMLやXMLを簡単に操作するためのパッケージ
RCurl
HTTPによる通信を制御することができるパッケージ
bio3d
タンパク質の配列や構造を解析するためのパッケージ
XML
XMLやHTMLを読み込んだり、作成するためのパッケージ
purrr
関数型プログラミングを行うためのパッケージ
tibble
データフレームの拡張版。
ape
系統樹を編集するためのパッケージ